Dalam biologi, untuk mendeskripsikan organisme tertentu, yang termasuk dalam kingdom hewan, jamur atau tumbuhan, telah dikembangkan tatanamanya sendiri. Ini mencerminkan milik satu spesies, tergantung pada karakteristik morfologi dan penampilan. Untuk hewan, kriteria untuk merujuk pada suatu spesies diterapkan, tergantung pada kemampuan untuk menghasilkan keturunan yang subur selama pembuahan. Namun, pola ini hanya berlaku untuk organisme ini, sedangkan mikroba tidak dapat diklasifikasikan dengan cara ini.
Konsep regangan dalam mikrobiologi
Karena keberadaan sejumlah besar organisme yang memiliki sifat morfologis, tetapi fitur biokimia dan imunologis yang berbeda, tidak mungkin untuk menerapkan nomenklatur standar untuk penamaan. Akibatnya, konsep seperti regangan diperkenalkan. Ini adalah biakan murni mikroba yang telah diisolasi dan diisolasi di suatu tempat tertentu pada jam tertentu.
Setiap mikroba yang termasuk dalam satu galur mirip dengan yang lain perwakilan dalam hal kriteria biokimia, morfologi, imunologi dan genetik. Tetapi dalam spesies bakteri yang sama, analogi seperti itu tidak diamati. Oleh karena itu, strain adalah nama yang lebih fleksibel untuk kultur mikroba. Karena cepatPertukaran materi genetik (mutasi) menyebabkan munculnya organisme baru dalam suatu spesies, tetapi dengan sifat yang berbeda, definisi inilah yang memungkinkan kita untuk lebih akurat mengkarakterisasi faktor patogenisitas dan virulensi.
Strain bakteri
Nomenklatur bakteri yang ada memungkinkan untuk mengklasifikasikan jenis organisme, tetapi tidak mencirikan sifat baru mereka. Yang terakhir muncul sebagai akibat dari mutasi yang cepat, memperoleh sifat-sifat baru, termasuk yang bersifat patogen bagi manusia, hewan ternak dan tumbuhan, serta mikroba lainnya. Contoh tata nama menggunakan contoh Escherichia coli terlihat seperti ini: kingdom - bakteri, tipe - Proteobacteria, kelas gamma-proteobacteria, ordo - Enterobacteriales, famili Enterobacteria. Genusnya adalah Escherichia dan spesiesnya adalah Escherichia colli. Namun, ada banyak kultur bakteri dari spesies Escherichia colli, yang menunjukkan sifat yang berbeda. Mereka diisolasi menjadi strain bakteri yang terpisah dan memiliki nama tambahan. Misalnya Escherichia colli O157:H7.
E. coli sendiri ada di usus manusia dan tidak menyebabkan penyakit, tetapi galur O157:H7 secara eksklusif bersifat patogen karena adanya sejumlah besar faktor virulensi. Dia telah mengalami epidemi penyakit enterotoksigenik dalam 5 tahun terakhir.
Strain virus
Konsep strain adalah nama yang fleksibel untuk organisme dengan sifat yang sama yang diisolasi, kemudian diidentifikasi dan dideskripsikan di area tertentu pada waktu tertentu. Dengan perjalanannya, virus dapat memperoleh sifat baru karena sifat antigenikmelayang. Ini akan menciptakan strain virus baru, mungkin lebih patogen daripada induknya.
Anda dapat dengan jelas menunjukkan munculnya galur baru menggunakan contoh virus influenza. Itu milik keluarga Orthomyxoviruses dan diberi nama tergantung pada antigen (hemagglutinin dan neuraminidase) HxNy. X dan Y adalah nilai numerik yang mencerminkan keberadaan antigen. Contohnya adalah H5N1, yang dikenal dengan epidemi flu babi baru-baru ini dengan pneumonia hemoragik progresif cepat. Menurut teori, strain baru dan lebih berbahaya dapat berkembang dari strain ini karena antigenic drift yang sama.
Strain jamur dan strain protista
Jamur adalah yang paling tidak bervariasi dari semua mikroba, meskipun biokimia mereka juga kompleks. Karena struktur yang lebih kompleks daripada bakteri dan virus, dan juga karena kurangnya mekanisme untuk transfer gen yang cepat, jumlah strain jamur baru sedikit meningkat. Ada juga pendapat bahwa setiap strain jamur yang baru ditemukan adalah organisme yang sudah ada sebelumnya yang tidak ditemukan oleh peneliti.
Situasi serupa terjadi di kingdom protista. Kemampuan mereka untuk bermutasi rendah, sehingga kemungkinan strain baru akan muncul dengan cepat sangat kecil. Namun, varian baru organisme dari spesies yang sama masih muncul. Oleh karena itu, tampaknya, mereka juga ada lebih awal, tetapi tidak ditemukan.
