Jenis ikatan amida yang terjadi selama pembentukan protein peptida setelah interaksi dua asam amino, ini adalah jawaban dari pertanyaan tentang apa itu ikatan peptida.
Dari sepasang asam amino, muncul dipeptida, yaitu rantai asam amino ini, ditambah molekul air. Menurut sistem yang sama, rantai yang lebih panjang dihasilkan dari asam amino di ribosom, yaitu polipeptida dan protein.
Properti Rantai
Berbagai asam amino, yang merupakan sejenis "bahan pembangun" protein, memiliki radikal R.
Seperti halnya amida, ikatan peptida dari protein rantai C-N, melalui interaksi struktur kanonik antara karbon karbonil dan atom nitrogen, biasanya memiliki sifat ganda. Ini biasanya menemukan ekspresi dalam mengurangi panjangnya menjadi 1,33 angstrom.
Semua ini mengarah pada kesimpulan berikut:
- C, H, O dan N - 4 atom yang terhubung, ditambah 2 a-karbon terletak pada bidang yang sama. Gugus R asam amino danhidrogen a-karbon sudah berada di luar zona ini.
- H dan O dalam ikatan peptida asam amino dan karbon-a dari pasangan asam amino berorientasi trans, meskipun isomer trans lebih stabil. Dalam asam L-amino, gugus R juga berorientasi trans, yang ada di semua peptida dan protein di alam.
- Rotasi di sekitar rantai C-N sulit, rotasi di tautan C-C lebih mungkin.
Untuk memahami apa itu ikatan peptida, serta untuk mendeteksi peptida itu sendiri dengan protein dan menentukan jumlahnya dalam larutan tertentu, gunakan reaksi biuret.
Pengaturan atom
Koneksi pada peptida protein lebih pendek dibandingkan dengan kelompok peptida lainnya, karena memiliki karakteristik ikatan rangkap parsial. Mempertimbangkan apa itu ikatan peptida, kita dapat menyimpulkan bahwa mobilitasnya rendah.
Konstruksi elektronik dari ikatan peptida menetapkan struktur planar padat dari sekelompok peptida. Bidang kelompok tersebut terletak pada sudut satu sama lain. Ikatan antara atom a-karbon dan gugus a-karboksil dan a-amino dapat berputar bebas di sepanjang sumbunya, sementara ukuran dan sifat radikalnya terbatas, dan ini memungkinkan rantai polipeptida untuk mengatur dirinya sendiri secara bervariasi. pengaturan.
Ikatan peptida dalam protein, sebagai aturan, berada dalam konfigurasi trans, yaitu, susunan atom karbon-a terletak di berbagai bagian grup. Hasilnya adalah lokasi radikal samping dalam asam amino pada jarak yang lebih jauh dalam ruang satu sama lain.teman.
Protein pecah
Saat mempelajari apa itu ikatan peptida, kekuatannya biasanya diperhitungkan. Rantai seperti itu tidak putus dengan sendirinya dalam kondisi normal di dalam sel. Yaitu, pada suhu tubuh yang sesuai dan lingkungan yang netral.
Dalam kondisi laboratorium, hidrolisis rantai peptida protein dipelajari dalam ampul tertutup, di dalamnya terdapat asam klorida pekat, pada suhu lebih dari seratus lima derajat Celcius. Hidrolisis protein lengkap menjadi asam amino bebas terjadi dalam waktu sekitar 24 jam.
Pada pertanyaan tentang apa ikatan peptida di dalam organisme hidup, maka pemutusan terjadi dengan partisipasi enzim proteolitik tertentu. Untuk menemukan peptida dan protein dalam suatu larutan, serta untuk mengetahui jumlahnya, mereka menggunakan hasil positif dari zat yang mengandung dua atau lebih ikatan peptida, yaitu reaksi biuret.
Pengganti asam amino
Di dalam hemoglobin S abnormal, 2 rantai bermutasi, di mana glutamat, serta asam amino polar bermuatan negatif di posisi keenam, diganti dengan valin hidrofobik yang mengandung radikal.
Di dalam hemoglobin yang bermutasi adalah wilayah yang melengkapi wilayah lain dengan molekul yang sama yang mengandung asam amino yang diubah. Pada akhirnya, molekul hemoglobin "menempel bersama" dan membentuk agregat fibrilar panjang yang mengubah sel darah merah dan menyebabkan munculnya sel darah merah berbentuk bulan sabit yang bermutasi.
Di dalam oksihemoglobin S, sebagai akibat dari perubahan konformasi protein, situs komplementer tertutup. Kurangnya akses ke sana membuat molekul tidak mungkin terhubung satu sama lain dalam oksihemoglobin ini. Ada kondisi yang kondusif untuk pembentukan agregat HbS. Mereka meningkatkan akumulasi deoxyhemoglobin di dalam sel. Ini mungkin termasuk:
- hipoksia;
- kondisi pegunungan;
- kerja fisik;
- penerbangan pesawat.
Anemia Sel Sabit
Karena eritrosit berbentuk sabit memiliki permeabilitas rendah melalui kapiler jaringan, mereka dapat memblokir pembuluh darah dan dengan demikian menciptakan hipoksia lokal. Ini akan meningkatkan akumulasi deoxyhemoglobin S di dalam sel darah merah, serta kecepatan munculnya agregat S-hemoglobin dan menciptakan lebih banyak kondisi untuk deformasi sel darah merah.
Penyakit sel sabit adalah penyakit resesif homozigot yang terjadi hanya ketika kedua orang tua mewariskan sepasang gen rantai yang bermutasi. Setelah bayi lahir, penyakit tidak bermanifestasi sampai sejumlah besar HbF diubah menjadi HbS. Pasien menunjukkan gejala klinis yang khas dari anemia, yaitu: sakit kepala dan pusing, jantung berdebar, sesak napas, lemah terhadap infeksi, dan sebagainya.
